分子信標(Molecularbeacon)是一種熒光標記的寡核苷酸鏈。一般有三部分組成:①環(huán)狀區(qū):由15~30個可以與靶分子特異結合的核苷酸組成;②莖干區(qū):一般由5~8個可發(fā)生可逆性解離的堿基對組成;③熒光基團和淬滅基團:分子信標的兩個末端分別標記熒光基團和淬滅基團。如圖1-13所示,沒有靶分子的時候,分子信標的熒光和淬滅基團靠得很近,熒光被淬滅。與靶分子結合后,分子信標的空間構型發(fā)生改變,導致熒光恢復。因為分子信標技術具有極高的特異性和靈敏度,所以在臨床診斷、基因檢測、環(huán)境監(jiān)測、活細胞成像、基因芯片與生物傳感等方面得到了廣泛應用。最近幾年,為了提高檢測目標分子的靈敏度,循環(huán)擴增技術在分子信標中的應用成為了研究熱點,并廣泛地應用于了各類目標分子的檢測中去。

中文名

分子信標

外文名

molecular beacon

提出者

Tyagi

不足

穩(wěn)定性差

分類

標記分子信標

特點

靈敏度高,操作簡單,檢測成本低

發(fā)明時間

1996

簡介

分子信標

分子信標的莖環(huán)結構中,環(huán)一般為15-30個核苷酸長,并與目標序列互補;莖一般5-7個核苷酸長,并相互配對形成莖的結構。

分類:

標記分子信標:

標記分子信標的熒光基團標記在探針的一端,而淬滅劑則標記在另一端。在復性溫度下,因為模板不存在時形成莖環(huán)結構,當加熱變性會互補配對的莖環(huán)雙鏈解開,如果有模板存在環(huán)序列將與模板配對。與模板配對后,分子信標將成鏈狀而非發(fā)夾狀,使得熒光基團與淬滅劑分開。當熒光基團被激發(fā)時,因淬滅作用被解除,發(fā)出激發(fā)光子。熒光強度與溶液中模板的量呈正比。所以可以用與PCR定量分析。由于是酶切作用的存在,分子信標也是積累熒光。常用的熒光基團:FAM,TexasRed,TAMRA。

免標記分子信標:

特點

:靈敏度高,操作簡單,檢測成本低。

不足

:雜交時探針不能肯定完全與模板結合,所以穩(wěn)定性差,

分子信標技術結合不同于熒光標記,可用于基因多突變位點同時分析

和結核桿菌耐藥基因rpoB的耐藥分析不足

結構

分子信標的設計一般包括三個部分:

(1)環(huán)狀區(qū):一般為長度15~30堿基的序列,能與目標分子特異結合;

(2)信標莖干區(qū):通常為長度5~8個堿基的互補序列,莖干區(qū)與雜交后環(huán)狀區(qū)-目標分子的雙鏈結構之間的熱力學平衡關系,使分子信標的雜交特異性明顯高于常規(guī)的線狀探針;

(3)熒光基團和淬滅基團,熒光基團一般聯(lián)接在信標分子的5端;淬滅基團聯(lián)接在3’端。圖1為經(jīng)典的分子信標結構,其中1—氨基萘—8—羧酸(EDANS)為熒光素,二甲氨基偶氮苯甲酰(DABSYL)為淬滅劑。分子信標中常用4—(4’—二甲基氨基偶氮苯基)苯甲酸(DABCYL)作為淬滅基團,德克薩斯紅(TexasRed)、熒光素(Fluoresein)等作為熒光基團。

原理

對于標記分子信標來說,自由狀態(tài)時,發(fā)夾結構的兩個末端,使熒光分子與猝滅分子靠近(約為7—10nm)。此時發(fā)生熒光共振能量轉移,使熒光分子發(fā)出的熒光被猝滅分子吸收并以熱的形式散發(fā),熒光幾乎完全被猝滅,熒光本底極低。當分子信標與序列完全互補的靶標分子結合形成雙鏈雜交體時,信標莖桿互補區(qū)被拉開,熒光分子和猝滅分子距離增大。根據(jù)Foerster理論,中心熒光能量轉移效率與兩者距離的6次方成反比。雜交后,信標分子的熒光幾乎100%恢復。且所檢測到的熒光強度與溶液中靶標的量成正比。

免標記分子信標是通過反應后分子信標被打開,原本封閉在莖部的特定的能與染料結合的DNA序列被釋放出來并與染料結合,造成檢測信號的變化,對目標分子進行檢測。檢測信號通常有比色和熒光兩種。

應用

(1)核酸檢測分析

(2)分子信標用于研究DNA—蛋白質的相互作用

(3)分子信標用作生物芯片和生物傳感器的探針

(4)分子信標用作酶動力學研究以及小分子藥物的篩選

(5)分子信標用于重金屬有毒物質的定量檢測

(6)分子信標用于有毒殘留抗生素等物質的研究

(7)分子信標用于腫瘤標志物的研究,如:miRNA

展望

近年來,分子信標因具有靈敏度高,特異結合性好等優(yōu)點而被廣泛應用于生物學和生物分析領域。在注重功能基因研究的后基因組時期,分子信標將會被更多地應用于基因突變引起的疾病的研究、活細胞中RNA的檢測、蛋白質的檢測及生物芯片研究等。隨著分子信標技術的發(fā)展和新型分子信標的不斷出現(xiàn),分子信標將會在基因診斷、基因治療以及新藥的研制開發(fā)等方面得到越來越廣泛的應用。