第1話“挑戰(zhàn)太陽(yáng)的人”
為追求蘊(yùn)藏著強(qiáng)大力量的“賢者之石”而持續(xù)旅行的艾爾利克兄弟,哥哥愛德華,是史上最年輕獲得國(guó)家煉金術(shù)師資格的天才煉金術(shù)師,弟弟阿爾馮斯,雖然外表是壯碩盔甲姿態(tài),事實(shí)上是個(gè)非常溫柔體貼的少年。來(lái)到東方邊境的小鎮(zhèn)里歐爾的兩人,在那里他們目擊了自稱為太陽(yáng)神雷特代理人,柯奈洛教主的“奇跡之術(shù)”。
第2話“禁忌的身體”
因關(guān)系到“賢者之石”,艾爾利克兄弟在里歐爾教會(huì)的秘密地下室與柯奈洛教主對(duì)決。但是卻遭到察覺教主有危機(jī)的雷特教信徒們打斷。兩人雖然逃到街上,但卻被信仰深厚的里歐爾鎮(zhèn)民發(fā)現(xiàn)并包圍。因“奇跡之術(shù)”而動(dòng)起來(lái)的雷特神像,致使阿爾被破壞、愛德被逮捕,并且被拖到柯奈洛的面前。
第3話“母親…”
在旅途中順路繞進(jìn)的街角舊書店里,找到了煉金術(shù)入門書的愛德和阿爾,回想起了閱讀這本書學(xué)習(xí)時(shí)的往事。那是在兩人還很幼小的時(shí)候,在故鄉(xiāng)利賽布爾村生活的事。他們想看到母親開心的笑容,為了這個(gè)單純的心愿,兩人開始爭(zhēng)相學(xué)習(xí)煉金術(shù)。
第4話“愛的煉成”
為了成為國(guó)家煉金術(shù)師,艾爾利克兄弟離開故鄉(xiāng)利賽布爾出外旅行。旅途中聽到煉金術(shù)師馬吉哈魯?shù)膫髀?,而前往造訪其居住的村莊,但那個(gè)村子卻傳出死人復(fù)活陸續(xù)攻擊活人的不祥謠言。
第5話“疾走!機(jī)械鎧!”
為了成為國(guó)家煉金術(shù)師,愛德華與阿爾朝向中央市前進(jìn)。當(dāng)打電話向馬斯坦中校報(bào)告自己即將到達(dá)的消息時(shí),出乎意料的被命令搭上下一班列車。于是兩人遂急忙跳上指定的火車。沒想到,與家人出來(lái)旅行的哈克洛將軍正好也在該列車上。
第6話“國(guó)家煉金術(shù)師資格考試”
為了準(zhǔn)備國(guó)家煉金術(shù)師資格考試,愛德華與阿爾住進(jìn)了由馬斯坦介紹的,生物體煉成界的第一人“綴命之煉金術(shù)師”修?塔卡的家中。受到塔卡的女兒妮娜與愛犬亞歷山大的鼓勵(lì),兄弟倆每天都埋首苦讀。然后,考試當(dāng)天,愛德華與阿爾前去應(yīng)考了。 第7話“合成獸慟哭之夜”
愛德華以12歲的年紀(jì)通過(guò)“國(guó)家煉金術(shù)師資格考試”的試驗(yàn),成為了史上最年輕的合格者,并從馬斯坦手中接下了作為國(guó)家煉金術(shù)師證明的銀懷表。然后塔卡家舉辦了慶祝派對(duì),妮娜與亞歷山大玩得不亦樂乎。但塔卡此時(shí)卻為了即將到了的審定日子,被逼入了絕境。
第8話“賢者之石”
愛德華沒能解救妮娜,內(nèi)心備受后悔與無(wú)力感的煎熬。馬斯坦此時(shí)卻命令愛德華去分析塔卡留下的研究,愛德華對(duì)這樣“冷酷”的命令感到非常憤怒,一個(gè)人獨(dú)自開始搜索殺害妮娜的犯人。
第9話“軍隊(duì)走狗的銀懷表”
感受到自己的渺小與無(wú)力,為了要達(dá)成自己的目的,愛德華決意成為國(guó)家煉金術(shù)師,但在得到種種特權(quán)的同時(shí),也意味著將成為“軍方的走狗”。隨后,愛德華接到了馬斯坦所下達(dá)的身為國(guó)家煉金術(shù)師的第一個(gè)任務(wù)。
第10話“怪盜賽壬”
在前往和馬斯坦做報(bào)告的途中,兄弟倆在水之都阿庫(kù)羅亞中途下車。阿庫(kù)羅亞是有名的觀光勝地,但最近卻有位名叫“賽壬”的怪盜出沒。該人身份不明,唯一的線索只有這家伙會(huì)使用煉金術(shù)。兄弟二人接受了街上刑警的委托,協(xié)助幫忙尋找怪盜。
第11話“砂礫的大地·前篇”
聽到“賢者之石”的傳言,愛德華與阿爾來(lái)到了黃金的產(chǎn)地杰諾塔姆。這里曾是繁極一時(shí)的城鎮(zhèn),不知從何時(shí)開始漸漸沒落下來(lái),于是鎮(zhèn)民們便把最后的希望寄托在馬古瓦爾所研究的“賢者之石”之上。而愛德華與阿爾在那里得知了冒牌艾爾利克兄弟的存在。
第12話“砂礫的大地·后篇”
瑟爾和弗雷查打著艾爾利克兄弟的名號(hào),繼續(xù)從事著“賢者之石”的研究。為了從“紅水”中精制出“賢者之石”,拉瑟爾依照馬古瓦爾的指示實(shí)行了某個(gè)方法,但最后由于他們實(shí)在無(wú)法狠下心來(lái)實(shí)行,遂被逮捕到地下牢房。 第13話“焰 VS 鋼”
身為國(guó)家煉金術(shù)師必須提出調(diào)查報(bào)告,為了這個(gè)目的,愛德華與阿爾馮斯來(lái)到了東方司令部。當(dāng)愛德華尋問(wèn)馬斯坦自己在杰諾塔姆所聽到的關(guān)于馬可醫(yī)生謠言時(shí),卻被巧妙地避開了話題。于是愛德華心生一計(jì),決定以馬可的情報(bào)為賭注,向馬斯坦提出了模擬戰(zhàn)斗的要求。
第14話“破壞的右手”
過(guò)去在伊修巴爾內(nèi)戰(zhàn)中從軍方脫逃的前國(guó)家煉金術(shù)師馬可醫(yī)生。兄弟二人為了拜訪這位“賢者之石”的研究者,來(lái)到了海德村。愛德華要求馬可讓自己看當(dāng)初從軍方帶走的“賢者之石”的研究資料。
第15話“伊修巴爾大屠殺”
遭到斯卡追殺的愛德華與阿爾,在千鈞一發(fā)之際被阿姆斯特朗解救,并帶著馬可一起逃命。當(dāng)馬可知道斯卡是伊修巴爾人之后,便開始談起過(guò)去發(fā)生的那場(chǎng)戰(zhàn)爭(zhēng),伊修巴爾內(nèi)亂凄慘的事實(shí)真相。
第16話“失去的東西”
為了修理被斯卡破壞的機(jī)械鎧,愛德華與阿爾和隨身保護(hù)他們的阿姆斯特朗一同前往利賽布爾。馬可秘密給予的紙條中,記載著“賢者之石”相關(guān)研究資料的藏匿處,中央圖書館第一分館。為了好不容易掌握到的“賢者之石”線索,兩人又再度出發(fā)。
第17話“有家人等待的家”
為了修理機(jī)械鎧,愛德華、阿爾與阿姆斯特朗回到了利賽布爾。自從放火燒掉自己的家,開始旅行尋找“賢者之石”的那一天起,這是四年來(lái)第一次返鄉(xiāng)。比拿可與溫莉雖然講話刻薄,但還是很溫馨地迎接二人的歸來(lái)。
第18話“馬可手記”
為了得到馬可留下的“賢者之石”研究資料,愛德華與阿爾再度造訪中央市。然而資料的保管地點(diǎn)中央圖書館第一分館確早已因火災(zāi)而焚毀,根據(jù)目擊者的證言推測(cè),犯人是斯卡。
第19話“真相中的真相”
為了取回失去的一切,艾爾利克兄弟長(zhǎng)久以來(lái)追求的“賢者之石”,那是犧牲許多人的生命才制造出來(lái)的東西。這個(gè)沖擊性的事實(shí)真相幾乎讓愛德華崩潰,但是他還是決定要探究馬可留下的筆記“真實(shí)的深處的深處”的真意。
第20話“守護(hù)者的靈魂”
愛德華與阿爾查出了“賢者之石”的研究場(chǎng)所是第五研究所。這個(gè)本來(lái)應(yīng)該已成廢墟的這個(gè)地方,卻有著重重戒備與無(wú)數(shù)的機(jī)關(guān)。而此時(shí)出現(xiàn)了襲擊愛德華與阿爾的兩個(gè)黑影,死刑犯48號(hào)與66號(hào)。
第21話“紅色光芒”
愛德華與48號(hào)的死斗在第五研究所展開,圍繞著“賢者之石”的情報(bào),緊湊而無(wú)法喘息的一進(jìn)一退攻防戰(zhàn)持續(xù)進(jìn)行著。另一方面在研究所的中庭,阿爾馮斯與66號(hào)的心理層面戰(zhàn)斗也即將開始。
第22話“被造出的人類”
愛德華終于闖進(jìn)第五研究所的深處。為了將煉金術(shù)轉(zhuǎn)用于軍事用途,這個(gè)地方曾經(jīng)進(jìn)行了大規(guī)模的生物體煉成研究,研究所內(nèi)仍存在著大量未完成的“賢者之石”與巨大的煉成陣。此時(shí)塔卡向愛德華提議,利用這些材料來(lái)完成“賢者之石”。
第23話“鋼鐵之心”
傷痕累累的愛德華,意識(shí)朦朧地在醫(yī)院病床上醒過(guò)來(lái)。而阿爾則是身體幾近半壞的狀態(tài)下,被放在房間的角落。只差一步就可以得到“賢者之石”,但怎么也無(wú)法跨出那一步,這件事束縛著愛德的心。而阿爾與66號(hào)交手之后,就一直抱持著某個(gè)疑問(wèn)。
第24話“回憶的固定”
自己的靈魂說(shuō)不定也是偽造的,被這個(gè)疑問(wèn)所困擾的阿爾,從愛德的面前逃開。茫然佇立于街頭的他,在那里遇到了伊修巴爾人的少年兄弟雷歐與利克。阿爾在兄弟倆的帶領(lǐng)下造訪伊修巴爾的秘密營(yíng)地,在那里他遇見了意想不到的人物。 第25話“別離的儀式”
雖然在第五研究所獲知了賢者之石的真相,愛德華與阿爾還是決定另尋他法來(lái)恢復(fù)原本擁有的身體。二人為了追求那個(gè)可能性,決定離開中央市。另一方面,持續(xù)調(diào)查第五研究所與賢者之石的休斯,最后發(fā)現(xiàn)到了某件事實(shí)。
第26話“她的理由”
愛德華、阿爾以及溫莉三人來(lái)到了機(jī)械鎧圣地拉修巴雷。面對(duì)街上一排排的機(jī)械鎧工作室,溫莉顯得極為興奮。三人在拉修巴雷特有的機(jī)械鎧腕力大賽中,遇到了右手腕與雙足都是機(jī)械鎧的少女帕妮娘。
第27話“師父”
愛德華與阿爾兩人在拉修巴雷被他們最害怕的人煉金術(shù)師父伊茲米逮到。愛德華成為“軍方的走狗”國(guó)家煉金術(shù)師一事令伊茲米氣得怒火攻心,于是將兩人拉往達(dá)普利斯。另一方面,東方司令部的馬斯坦這邊,收到了調(diào)往中央市的正式公文。
第28話“一即是全、全即是一”
“現(xiàn)在的他們所需要的是偶爾停下來(lái)好好思考?!币疗澝自俅螌鄣氯A與阿爾兩人帶到約克島。那里是二人年幼時(shí)期為了修行所待過(guò)的地方。島上還殘留著好幾處當(dāng)時(shí)所留下的痕跡,二人一邊回憶著過(guò)去一邊重新檢視自己。
第29話“無(wú)垢的孩子”
愛德華與阿爾在約克島一邊回憶往事,一邊懺悔自己犯下的過(guò)錯(cuò),并下定決心為了挽回一切,要繼續(xù)前進(jìn)。此時(shí),應(yīng)該沒有任何人在的森林里,出現(xiàn)了一名使用著煉金術(shù)的神秘少年。
第30話“南方司令部襲擊”
伊茲米從約克島帶回的少年,少年右肩上有道舊傷痕,那道傷痕和愛德華幼年在約克島修行時(shí)所受的傷痕非常相似,少年在愛德華的逼問(wèn)下逃走了。另一方面,休斯的繼任者法蘭克·亞伽中校陪伴阿姆斯特朗少校搜索著愛德華等人的下落,來(lái)到了達(dá)普利斯。
第31話“罪”
右足擁有銜尾蛇紋章的少年,為了爭(zhēng)奪此人,軍方、金布利、艾爾利克兄弟、以及伊茲米等眾人在南方司令部僵持不下。另一方面,馬斯坦奉大總統(tǒng)之命,為了逮捕斯卡,率領(lǐng)軍隊(duì)到齊修亞近郊的貧民窟。
第32話“深林中的但丁”
擁有愛德華失去的右手腕與左腳的少年拉斯,他是過(guò)去伊茲米進(jìn)行人體煉成后失敗的結(jié)果,被創(chuàng)造出來(lái)的人造人。拉斯期望可以成為人類,為了搶奪剩余的身體而襲擊愛德。
第33話“被囚禁的阿爾”
在伊茲米師父的但丁之館,阿爾遭到格利德率領(lǐng)的合成獸軍團(tuán)襲擊,被強(qiáng)行擄走。阿爾被囚禁在他們的根據(jù)地,郊區(qū)的酒吧惡魔之巢,在那里,格利德逼問(wèn)阿爾關(guān)于永遠(yuǎn)的生命的秘密。
第34話“貪婪的理論”
在惡魔之巢展開了不穩(wěn)份子的殲滅作戰(zhàn),亞伽隊(duì)的士兵接二連三地射殺著格利德一派的合成獸,在混戰(zhàn)之中,格利德遭到金布利與塔卡的背叛,又受到拉絲特、格拉托尼的襲擊,漸漸被逼入絕境。
第35話“愚者的再會(huì)”
拉絲特偶然遇見了知道她的過(guò)去的青年路瓊。二年前,為了找出流行于故鄉(xiāng)村落的原因不明的怪病“化石病”的治療方法,路瓊?cè)找岳^夜拼命地研究煉金術(shù)。
第36話“我心中的罪人”
在南部邊境地帶,愛德與阿爾接觸了被軍方護(hù)送的伊修巴爾人,得知有位老人知道有關(guān)于過(guò)去伊修巴爾曾經(jīng)制造過(guò)“賢者之石”的事。愛德、阿爾以及溫莉,遂前往老人所居住的,位在齊修亞西邊的貧民窟。
第37話“焰之煉金術(shù)師……”
哈勃克少尉奉軍內(nèi)務(wù)課之命對(duì)馬斯坦上校進(jìn)行監(jiān)視,他和布萊達(dá)、法爾曼、菲利一起秘密寫下《羅伊·馬斯坦觀察日記》。陸續(xù)揭開的馬斯坦上校那鮮為人知的日常生活。 第38話“隨川而流”
在前往伊修巴爾的旅行途中,愛德與阿爾為了是要以阻止斯卡為優(yōu)先,還是恢復(fù)自己的身體為優(yōu)先而意見不合。另一方,在休斯的墳前,謝絲卡和溫莉偶然相遇,獨(dú)自調(diào)查休斯事件的謝絲卡,終于歸納出了一個(gè)假設(shè)。
第39話“東方內(nèi)戰(zhàn)”
旅行途中,瑪黛兒向愛德華和阿爾道出自己與多魯契德、羅亞等人在特殊部隊(duì)服役時(shí)的過(guò)去。伊修巴爾內(nèi)戰(zhàn)的真相和第五研究所的真實(shí)在此漸漸明朗化。就在此時(shí),為了鎮(zhèn)壓反抗勢(shì)力,亞伽率領(lǐng)的軍隊(duì)到達(dá)了里歐爾鎮(zhèn)。
第40話“傷痕”
金布利背叛格利德并出賣同伴,倒戈重返軍方。為了替同伴報(bào)仇,瑪黛兒不顧阿爾的制止,猛然地發(fā)動(dòng)了攻擊。另一方面,愛德和斯卡在里歐爾鎮(zhèn)對(duì)峙著。
第41話“圣母”
失去了領(lǐng)導(dǎo)者,里歐爾陷入一片混亂,趁著這股混亂,軍方?jīng)Q定使用武力進(jìn)行軍事鎮(zhèn)壓,軍方的鎮(zhèn)壓部隊(duì)向市區(qū)進(jìn)軍。而斯卡則企圖利用里歐爾的混亂來(lái)完成賢者之石。
第42話“不知其名”
追求賢者之石的人必定招來(lái)滅亡的傳說(shuō),再次因?yàn)橐粋€(gè)名為里歐爾的城鎮(zhèn)的犧牲而誕生。奉大總統(tǒng)的特別命令,金布利率領(lǐng)合成獸部隊(duì)進(jìn)攻里歐爾的市區(qū),但是在他的面前,立誓為伊修巴爾復(fù)仇的斯卡堵住了他的去路。
第43話“野狗出逃”
突然從里歐爾的市街消失的愛德與阿爾。軍方與人造人追逐逼近著成為“賢者之石”的阿爾。在這局勢(shì)下,愛德與阿爾,向著利賽布爾的方向繼續(xù)逃亡。
第44話“光之霍恩海姆”
藏身在利賽布爾的愛德與阿爾的面前,出現(xiàn)了一位意外的人物。那是他們十幾年前就拋家不知去向的父親,霍恩海姆。
第45話“劣化心靈之物”
中央市舊市街,在那地下延伸的巨大都市遺跡的一角。光之霍恩海姆與但丁相對(duì)而見,兩人之間有著永遠(yuǎn)糾纏不清的緣份。事情回溯到四百年前,從他們終于抵達(dá)的那一天開始。
第46話“人體煉成”
決意要和人造人決一死戰(zhàn)的愛德,為了拿到拉斯的弱點(diǎn)而去拜訪了伊茲米。另一方面,被留下的阿爾,為了知道賢者之石的用法而去了某個(gè)地方,那里就是修?塔卡的秘密藏身之處。
第47話“封印人造人”
為了解救成為賢者之石的阿爾,愛德與斯洛斯兩人僵持對(duì)峙。阿爾在斯洛斯的身上仍感受到母親的殘影,而被困惑著。犯下的罪,真正的贖罪是要親手消除罪孽,愛德現(xiàn)在,挺身對(duì)抗斯洛斯。
第48話“后會(huì)有期”
愛德將斯洛斯的構(gòu)成物質(zhì)全部轉(zhuǎn)換成乙醇,那是觸犯禁忌者的,所無(wú)法避免的一條路。另一方,被送往北方的部隊(duì),飄蕩著詭異的氣氛。 第49話“到門的另一側(cè)”
為了追上被帶走的阿爾,愛德只身前往中央市。在那里從重逢的托林卡姆兄弟口中得知,在第五研究所前面,有個(gè)與“賢者之石”相關(guān)的巨大研究場(chǎng)。
第50話“死”
被經(jīng)由羅珊的嬰兒所出現(xiàn)的門所吞沒的愛德,被飛送到了門的另一邊的世界。那里是20世紀(jì)初的倫敦。在混亂中,愛德拼命逃離了齊柏林飛艇。此時(shí),但丁命令格拉托尼吃掉阿爾,想要得到完全的賢者之石。
第51話“慕尼黑1921”
馬斯坦先是在大總統(tǒng)府與普萊德對(duì)立,接著又和知曉事態(tài)而趕來(lái)的亞伽對(duì)峙。另一方面,在但丁的大宅里,恩維為了見霍恩海姆而消失到門的里面。最后愛德為了喚回最重要的東西,再度拍擊雙掌。